Comprendre votre certificat d'analyse

Une fois votre produit testé, vous recevrez un certificat d'analyse.

Quelle est la différence entre un certificat d'analyse et un certificat d'authenticité ?

Lister les types de certificats


Analyse génomique : identification de l'iris de Genovar

Votre certificat d'analyse contiendra une image de l'identification de l'iris de Genovar

L'iris représente les polymorphismes nucléotidiques simples (SNP) qui sont présents pour un cultivar de cannabis spécifique (Figure 6). Les SNP sont la forme la plus courante de variation de séquence d'ADN. Chaque SNP représente une différence dans un seul élément constitutif de l'ADN, appelé nucléotide. 
Concordance de cultivar génomique (G) - Relation génétique avec le cultivar enregistré mesurée en tant qu'identité par état (IBS) à l'aide de la matrice Lighthouse Genomics Cannabis 40k SNP.
Dans un enregistrement de cultivar de cannabis, la correspondance génomique des cultivars s'applique au niveau de parenté génétique entre la plante mère, la plante clone et la fleur finale. 
Dans un enregistrement de cultivar de chanvre, la correspondance génomique des cultivars s'applique au niveau de parenté génétique entre la feuille et la tige de chanvre avant et après la récolte. 
Les clones devraient avoir une parenté ≥ 98 %, les frères et sœurs 85 à 98 % et les cousins ​​78 à 90 %.

Analyse métabolomique : Empreinte métabolomique

L'empreinte métabolomique représente les métabolites présents pour un cultivar de cannabis spécifique en fonction du profil des métabolites RMN. L'empreinte métabolomique est quantitative, car elle représente le poids moléculaire relatif de chaque métabolite.

Certificat d'authenticité

Cotes de QI pour la vérification des produits enregistrés

Les cotes de QI s'appliquent aux produits démontrant des preuves de test « lot à lot » cohérentes, qui atteignent des intervalles de confiance d'au moins 90 % comme spécifié dans les exigences Purity-IQ CAPS. La certification de produit sera accordée uniquement aux produits contenus dans la bibliothèque de données Purity-IQ Global Registry – Cannabis.

Un intervalle de confiance (IC) est une mesure de la variation du profil métabolite du cultivar ou du produit homologué pour une matrice de produits spécifique.

Les intervalles de confiance indiqués dans le tableau ci-dessus indiquent le niveau de variation du profil des métabolites. Par exemple, un intervalle de confiance de ≥ 95 % à < 98 % indique que la variation du profil des métabolites se situe entre 2 et 5 % de l'échantillon de produit enregistré pour une matrice de produit spécifique.

Diagramme d'ordination

Le diagramme d'ordination montre les principales composantes d'un profil de métabolites, qui peuvent ensuite être mesurés à l'aide de statistiques multivariées. 

Dans ce cercle rose, on observe la relation entre une plante mère (point noir) et huit de ses plantes clones (points roses). Dans ce cas, toutes les plantes clones se situent dans un intervalle de confiance de 98 % par rapport à leur mère, ce qui indique une variation du profil métabolite de pas plus de 2 %. 

Définitions du rapport COA de Lighthouse Genomics 

SNP

Polymorphisme de nucléotide unique. Une seule différence entre deux chromosomes au même endroit dans le génome. Par exemple, à une position du génome, un chromosome peut avoir un A (le nucléotide Adénine) et un autre chromosome peut avoir un C (le nucléotide Cytosine).

Comment dose-t-on les SNP ? 

Nous examinons les SNP dans les génomes individuels. Comme cannabis est diploïde (c'est-à-dire qu'il a deux copies de chaque chromosome) il existe deux états possibles pour un SNP : les bases de chaque chromosome sont les mêmes (par exemple, AA ou CC) ; ou les deux bases sont différentes (par exemple, AC, GT). La plupart des SNP sont classés comme bialléliques, ce qui signifie que nous n'avons jamais observé que 2 des 4 nucléotides possibles à cette position dans le génome (par exemple, A et C, A et G, etc.). Dans le cas des SNP bialléliques, nous avons trois combinaisons possibles de nucléotides, que nous appelons génotypes. Par exemple, à un SNP pour lequel nous n'avons observé que A et C, nous pouvons avoir AA, AC et CC. Lorsque le SNP a un génotype où les deux allèles sont égaux (par exemple, AA), nous appelons cela un homozygote, et lorsque le SNP a un génotype où les allèles sont différents (par exemple, AC), nous appelons cela un hétérozygote. Le test que nous déployons interroge simultanément des milliers de positions/SNP dans le génome pour déterminer quel est l'état de chaque SNP dans le génome d'un échantillon. Il y a quatre résultats possibles pour chaque SNP, il peut aboutir à un génotype hétérozygote (l'individu a des nucléotides distincts à cette position dans le génome), il peut aboutir à l'un des deux génotypes homozygotes (l'individu a la même base sur les deux chromosomes à cette position), et enfin, le test peut échouer à ce locus. 

Total des marqueurs analysés

Le nombre de SNP (marqueurs) qui se trouvent sur la puce Lighthouse Genomics et qui sont mesurés/séquencés. 

Marqueurs analysés

Le nombre de marqueurs analysés après l'application des filtres. 

Taux d'appel

Le pourcentage de SNP dans lesquels un génotype sûr a été appelé pour un échantillon. À un locus où un appel n'a pas pu être effectué, cela signifie qu'il n'y avait pas de liaison à l'ADN matrice, les sondes ont échoué, l'ADN était de trop mauvaise qualité ou ce locus n'était pas présent dans l'échantillon.  

Homozygotie OBS

La proportion de locus homozygotes dans un échantillon. Un SNP est homozygote si l'ensemble des allèles à ce locus sont identiques. 1 – obs_homozygotie = obs_homozygotie. 

Coefficient de consanguinité

Une mesure du niveau de consanguinité d'un échantillon. Il varie de 0 à 1. C'est la probabilité que deux allèles à n'importe quel locus soient identiques par descendant. Plus clairement la probabilité que, si l'individu est AA à un locus, que les deux allèles proviennent du même chromosome d'un ancêtre. Par exemple, on peut imaginer qu'un individu est Aa à un locus, il transmet le A à deux de ses descendants, les deux descendants s'accouplent ensuite, et chacun apporte sa copie du A original à un descendant, donc le descendant est AA. Dans ce cas, les deux allèles proviennent du même chromosome chez le grand-parent et sont donc identiques par descendance.  

Premier PCA

Il s'agit d'un tracé d'analyse en composantes principales (ACP) des données génomiques de vos échantillons et de la population de référence organisée par Lighthouse Genomics. L'ACP est une méthode de réduction de données hautement dimensionnelles, telles que les données SNP, en 2 ou 3 dimensions pour la visualisation. À travers le premier composant principal, nous avons l'axe de plus grande variation, le deuxième composant principal est le deuxième axe avec le plus de variation, etc. Les échantillons génétiquement similaires se rapprocheront les uns des autres dans l'ACP, et ceux qui sont distincts seront plus éloignés une part. On s'attend à ce que les échantillons de clones tombent au même endroit sur le PCA, c'est pourquoi il ne peut y avoir qu'un ou deux points colorés sur le tracé. 

Complot d'araignée

Il s'agit d'un graphique montrant l'ampleur de l'identité par état (IBS) lorsque vous comparez votre échantillon à un ensemble de cultivars de référence de types connus. L'IBS est une mesure du rapport des SNP que deux cultivars partagent dans un état commun. IBS varie de 0 à 1, 0 signifiant que tous les loci sont à des états distincts entre les deux échantillons, et 1 signifiant que tous les loci ont le même état entre deux échantillons. Lors de l'examen d'un grand nombre de SNP, plus l'IBS est élevé (plus proche de 1), plus il est probable que les deux échantillons soient étroitement liés ou clones. Ce diagramme ne précise pas le type d'échantillon ou toute autre classification de l'échantillon. 

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